Şcoala Profesionlă „Danubius” a fost înfiinţată în anul 1960, din anul şcolar 1964 – 1965 funcţionând în actualul local.

     De-a lungul anilor instituţia a şcolarizat elevi la învăţamântul primar şi gimnazial, din anul şcolar 1990 - 1991 introducându-se şi un nivel superior – şcoala complementară, devenită şcoala de ucenici, iar din anul şcolar 2003 – 2004 – şcoala de arte şi meserii. Tot în anul şcolar 1990 – 1991, în şcoală au funcţionat şi clase de liceu, profil economic.

     Din anul şcolar 2005 – 2006 titulatura şcolii a devenit Şcoala de Arte şi Meserii Nr. 3 Tulcea. Începând cu 1 septembrie 2006, Şcoala cu cls. I-VIII Nr. 9 (actuala Școala Primară Nr.9)Tulcea a devenit structură a unităţii noastre.

     Din anul şcolar 2010-2011 şcolarizăm elevi de  nivel  gimnazial, la Învăţământul cu Frecvenţă Redusă iar în cadrul Programului „A doua şansă” elevi pentru învăţământul primar şi secundar inferior.

     În anul şcolar 2012-2013, unitatea și-a schimbat denumirea în Școala Profesională „Danubius”, școlarizând elevi care au terminat clasa a X-a la Stagii de pregătire practică și elevi înscriși în clasa  a X-a Învățământ profesional cu durata de 2 ani.

     În funcţie de cererea pieţei de muncă, la școala noastră au fost pregătiţi tineri în diverse meserii, domenii, calificări: pomicultor, viticultor, agricultor, broder manual mecanic, lenjer, menaj – gospodărie, sudor electric, ajutor ospătar, frizer.

     Ca şcoală de arte şi meserii am pregătit elevi care au absolvit clasa a X-a în domeniile: industrie textilă şi pielărie („Lucrător în tricotaje – confecţii”), mecanică („Lucrător în prelucrări la cald”), turism şi alimentaţie („Lucrător în alimentaţie”), estetica şi igiena corpului omenesc („Lucrător pentru estetica şi igiena corpului omenesc”). Din anul şcolar 2005 - 2006, prin anul de completare, a fost introdusă şi pregătirea în nivelul 2 pentru domeniul estetica şi igiena corpului omenesc, calificarea „Frizer – coafor – manichiurist – pedichiurist”. Din anul şcolar 2006 – 2007 planul de şcolarizare  a cuprins  şi elevi care se pregăteau  în domeniul comerţ („Lucrător în comerţ”), iar din  anul şcolar 2007-2008, în urma depunerii documentaţiei necesare şi a vizitei reprezentanţilor ARACIP în unitatea noastră, am obţinut autorizarea de funcţionare provizorie pentru nivelul de învăţământ profesional (an de completare)  domeniul Turism şi alimentaţie, calificarea profesională „Ospătar (chelner) vânzător în unităţi de alimentaţie” şi  domeniul Comerţ, calificarea profesională „Comerciant vânzător” (începând cu anul şcolar 2008-2009).